Sanger DNA dizilimi nasıl çalışır?
Sanger DNA dizilimi nasıl çalışır?

Video: Sanger DNA dizilimi nasıl çalışır?

Video: Sanger DNA dizilimi nasıl çalışır?
Video: DNA Dizileme-Sanger Yöntemi. 1. Bölüm. TÜRKÇE 2024, Kasım
Anonim

Sanger dizilimi 3' ucunda dideoksinükleotidler ile sonlanan çeşitli uzunluklarda uzama ürünlerinin oluşumu ile sonuçlanır. Uzatma ürünleri daha sonra Kapiler Elektroforez veya CE ile ayrılır. Moleküller, bir jel polimer ile doldurulmuş uzun bir cam kapiler içine bir elektrik akımı ile enjekte edilir.

Bu şekilde, Sanger DNA dizileme yöntemi nedir?

Sanger dizilimi zincir sonlandırma olarak da bilinir yöntem , için bir tekniktir DNA dizilimi tarafından zincir sonlandırıcı dideoksinükleotitlerin (ddNTP'ler) seçici olarak dahil edilmesine dayanan DNA in vitro sırasında polimeraz DNA çoğaltma. Frederick tarafından geliştirilmiştir. Sanger ve meslektaşları, 1977.

Ayrıca, zincir sonlandırma sıralaması nasıl çalışır? Sanger DNA'sı sıralama olarak da bilinir zincir - sonlandırma yöntemi sıralama . ddNTP'ler sonuçlanır sonlandırma çünkü ddNTP'ler, nükleotitler arasında fosfodiester bağı oluşumu için gerekli olan 3'-OH grubundan yoksundur. Bu bağ olmadan, zincir oluşan nükleotidlerin sonlandırılmış.

Basitçe öyleyse, neden Sanger dizilimi yapıyoruz?

Sanger sıralama a yöntem ile ilgili DNA dizilimi tarafından zincir sonlandırıcı dideoksinükleotitlerin seçici olarak dahil edilmesine dayanan DNA in vitro sırasında polimeraz DNA çoğaltma. Hala kısa okumaya göre avantajı var sıralama teknolojileri (Illumina gibi) Yapabilmek üretmek DNA dizisi > 500 nükleotid okur.

Sanger sıralaması doğru mu?

Sanger dizilimi %99,99 ile kesinlik klinik araştırmalar için “altın standart”tır sıralama . Bununla birlikte, daha yüksek verim yetenekleri ve numune başına daha düşük maliyetler nedeniyle daha yeni NGS teknolojileri de klinik araştırma laboratuvarlarında yaygınlaşmaktadır.

Önerilen: