Neden Sanger dizilimini kullanıyoruz?
Neden Sanger dizilimini kullanıyoruz?

Video: Neden Sanger dizilimini kullanıyoruz?

Video: Neden Sanger dizilimini kullanıyoruz?
Video: DNA Dizileme-Sanger Yöntemi. 1. Bölüm. TÜRKÇE 2024, Aralık
Anonim

Sanger dizilimi toplam örnek sayısının az olduğu durumlarda varyant tarama çalışmaları için etkili bir yaklaşımdır. Örnek sayısının yüksek olduğu varyant tarama çalışmaları için amplikon sıralama NGS ile daha verimli ve uygun maliyetlidir.

Benzer şekilde, Sanger dizilemenin amacı nedir diye sorabilirsiniz.

Sanger dizilimi in vitro DNA replikasyonu sırasında zincir sonlandırıcı dideoksinükleotitlerin DNA polimeraz tarafından seçici olarak dahil edilmesi işlemidir; SNV'lerin tespiti için en yaygın kullanılan yöntemdir.

Ayrıca Sanger dizilemesinde ddNTP'lerin neden kullanıldığını da bilin? dideoksinükleotidler zincir uzatma inhibitörleridir. DNA polimeraz, kullanılmış içinde Sanger için yöntem DNA dizilimi . Böylece, bu moleküller dideoksi zincir sonlandırma yönteminin temelini oluşturur. DNA dizilimi Frederick tarafından bildirilen Sanger ve ekibi, daha önceki çalışmaların bir uzantısı olarak 1977'de.

Ayrıca, NGS neden Sanger'dan daha iyi?

Sanger sıralama, bir seferde yalnızca bir parçayı sıralayabilir. Çünkü NGS milyonlarca DNA parçasını bağlayabilen akış hücrelerini kullanır, NGS tüm bu dizileri aynı anda okuyabilir. Bu yüksek verimli özellik, büyük miktarda DNA dizilirken çok uygun maliyetli olmasını sağlar.

Sanger dizilimi için neye ihtiyacınız var?

Malzemeler Sanger dizilimi Bunlar şunları içerir: DNA polimeraz enzimi. Tek sarmallı kısa bir parça olan bir astar DNA şablona bağlanan DNA ve polimeraz için bir "başlatıcı" görevi görür. Dört DNA nükleotidler (dATP, dTTP, dCTP, dGTP)

Önerilen: